Perguruan tinggi swasta (PTS) di bawah naungan Muhammadiyah menjadi salah satu pilihan menarik bagi calon mahasiswa yang ingin melanjutkan pendidikan di lingkungan kampus yang memiliki reputasi akademik baik. Sejumlah kampus Muhammadiyah bahkan telah meraih predikat akreditasi Unggul, yang menjadi salah satu indikator mutu perguruan tinggi.
Kampus Muhammadiyah yang tercantum antara lain Universitas Muhammadiyah Yogyakarta (UMY), Universitas Muhammadiyah Malang (UMM), Universitas Ahmad Dahlan (UAD), Universitas Muhammadiyah Surakarta (UMS), Universitas Muhammadiyah Sumatera Utara (UMSU), Universitas Muhammadiyah Surabaya (UMSurabaya), Universitas Muhammadiyah Purwokerto (UMP), Universitas Muhammadiyah Jakarta (UMJ), Universitas Muhammadiyah Tangerang (UMT), dan Universitas Muhammadiyah Sidoarjo (UMSIDA).
Selain itu, terdapat Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA (UHAMKA), Universitas ‘Aisyiyah Yogyakarta (UNISA Yogyakarta), Universitas Muhammadiyah Ponorogo (UMPO), Universitas Muhammadiyah Semarang (UNIMUS), serta Universitas Muhammadiyah Jember (UNMUH Jember). Deretan kampus tersebut menunjukkan perkembangan pendidikan tinggi Muhammadiyah yang semakin luas dan kompetitif, sehingga dapat menjadi pertimbangan bagi calon mahasiswa dalam menentukan kampus pilihan.